PapersFlow für Chemie, Wirkstoffforschung & Strukturbiologie
Eine einheitliche Forschungsplattform mit direktem Zugriff auf ChEMBL (2,5 Mio.+ Verbindungen, 13 Mio.+ Bioaktivitätsdatensätze), PubChem-Verbindungseigenschaften, ZINC (230 Mio.+ käufliche Verbindungen), PDB-Proteinstrukturen und UniProt (250 Mio.+ Proteineinträge). Durchsuchen Sie Datenbanken, rufen Sie Bioaktivitäts- und Strukturdaten ab und visualisieren Sie Moleküle als interaktive 2D-SMILES-Darstellungen — alles innerhalb einer einzigen KI-gestützten Forschungssitzung zusammen mit der wissenschaftlichen Literatur.
Fragen Sie ChEMBL-Bioaktivität, PubChem-Eigenschaften, in ZINC käufliche Verbindungen, PDB-Proteinstrukturen und UniProt-Proteinannotationen ab — mit eingebetteter 2D-SMILES-Molekülvisualisierung — alles über einen einzigen KI-Forschungsassistenten.
Forschung in Chemie und Wirkstoffforschung erfordert ständiges Wechseln zwischen isolierten Datenbanken. Sie durchsuchen ChEMBL in einem Tab nach Bioaktivitätsdaten, prüfen in einem anderen PubChem auf Verbindungseigenschaften, durchsuchen ZINC nach käuflichen Analoga, schlagen in PDB Protein-Ligand-Strukturen nach und gleichen in UniProt Proteinannotationen ab — während Sie in einem weiteren Fenster die Primärliteratur verfolgen. Jede Datenbank hat ihre eigene Abfragesyntax, ihr eigenes Ausgabeformat und keine Verbindung zu den Papers, die Sie gerade lesen. PapersFlow beseitigt diese Fragmentierung, indem alle fünf Datenbanken zusammen mit 474 Mio.+ wissenschaftlichen Papers in eine einzige dialogbasierte Oberfläche integriert werden, sodass Sie von der Literatursuche über die Verbindungsabfrage bis zur Strukturanalyse wechseln können, ohne jemals das Tool zu wechseln.
Was Sie tun können
- ChEMBL-Datenbank für Wirkstoffforschung
- PubChem-Verbindungseigenschaften
- ZINC-Datenbank (230 Mio.+ Verbindungen)
- PDB-Proteinstrukturen
Tools
Vergleichen
Frequently Asked Questions
- Was ist der Unterschied zwischen ChEMBL, PubChem und ZINC?
- Jede Datenbank dient einem anderen Zweck. ChEMBL enthält kuratierte Bioaktivitätsdaten — IC50-, EC50-, Ki- und Kd-Werte aus veröffentlichten Assays — und ist damit die zentrale Ressource, um zu verstehen, wie Verbindungen mit biologischen Zielstrukturen interagieren. PubChem liefert physikochemische Verbindungseigenschaften wie Molekulargewicht, LogP, TPSA und Wasserstoffbrückenzahlen, die für die Bewertung von Drug-Likeness- und ADMET-Eigenschaften nützlich sind. ZINC katalogisiert 230 Mio.+ kommerziell verfügbare Verbindungen mit Informationen zu Lieferanten und Käuflichkeit und ist damit essenziell, um kaufbare Analoga von Trefferverbindungen zu finden. PapersFlow ermöglicht es Ihnen, alle drei in derselben Forschungssitzung abzufragen.
- Kann ich nach SMILES-Notation suchen?
- Ja. Die ZINC-Datenbankintegration unterstützt die SMILES-Ähnlichkeitssuche mithilfe der Tanimoto-Distanz, sodass Sie einen SMILES-String einfügen und strukturell ähnliche käufliche Verbindungen finden können. Darüber hinaus werden alle Verbindungsergebnisse aus ChEMBL-, PubChem-, ZINC- und PDB-Ligandenabfragen, die SMILES-Daten enthalten, automatisch als interaktive 2D-Moleküldiagramme mit elementspezifischer Farbgebung gerendert, sodass Sie Strukturen visuell prüfen können, ohne die Unterhaltung zu verlassen.
- Sind Proteinstrukturdaten enthalten?
- Ja. PapersFlow integriert sowohl PDB als auch UniProt. Die PDB-Integration ermöglicht es Ihnen, nach Proteinstrukturen per Text oder Sequenz zu suchen und Metadaten wie Auflösung, experimentelle Methode, Atomanzahl und Details zu gebundenen Liganden einschließlich Liganden-SMILES, InChI und Summenformel abzurufen. UniProt liefert Proteinsequenzen, Annotationen funktioneller Domänen, posttranslationale Modifikationen und datenbankübergreifende ID-Zuordnung. Beachten Sie, dass PapersFlow Strukturmetadaten und Ligandeninformationen zurückgibt — es ist kein 3D-Molekülviewer, verknüpft Strukturdaten jedoch direkt mit Ihrer Literaturrecherche.
- Unterstützt es das ACS-Zitationsformat?
- Ja. Chemie-Ausgaben verwenden standardmäßig den ACS-Zitationsstil mit hochgestellten nummerierten Referenzen. Sie können formatierte Literaturverzeichnisse, .bib-Dateien und vollständige Manuskripte exportieren, die für JACS, ACS Nano, Chemistry of Materials und andere ACS-Publikationen formatiert sind.