PapersFlow للكيمياء واكتشاف الأدوية وعلم الأحياء البنيوي
منصة بحث موحدة مع وصول مباشر إلى ChEMBL (أكثر من 2.5 مليون مركب، وأكثر من 13 مليون سجل للنشاط الحيوي)، وخصائص المركبات في PubChem، وZINC (أكثر من 230 مليون مركب قابل للشراء)، وبنى البروتينات في PDB، وUniProt (أكثر من 250 مليون إدخال بروتيني). ابحث في قواعد البيانات، واسترجع بيانات النشاط الحيوي والبيانات البنيوية، وصوّر الجزيئات كرسومات SMILES ثنائية الأبعاد تفاعلية — كل ذلك ضمن جلسة بحث واحدة مدعومة بالذكاء الاصطناعي إلى جانب الأدبيات العلمية.
استعلم عن بيانات النشاط الحيوي في ChEMBL، وخصائص PubChem، والمركبات القابلة للشراء في ZINC، وبنى البروتينات في PDB، وتعليقات البروتينات التوضيحية في UniProt — مع عرض مرئي مضمّن للجزيئات بصيغة SMILES ثنائية الأبعاد — وكل ذلك من خلال مساعد بحث واحد مدعوم بالذكاء الاصطناعي.
يتطلب البحث في الكيمياء واكتشاف الأدوية انتقالًا مستمرًا بين قواعد بيانات معزولة. تبحث في ChEMBL عن بيانات النشاط الحيوي في علامة تبويب، ثم تتحقق من PubChem لخصائص المركبات في أخرى، وتتصفح ZINC للعثور على نظائر قابلة للشراء، وتراجع PDB لبنى البروتين-الربيطة، وتقارن ذلك مع UniProt لتعليقات البروتينات التوضيحية — وكل ذلك أثناء تتبع الأدبيات الأساسية في نافذة أخرى. لكل قاعدة بيانات صيغة استعلام خاصة بها، وتنسيق مخرجات مختلف، ولا توجد صلة مباشرة بالأوراق التي تقرؤها. يزيل PapersFlow هذا التشتت عبر دمج قواعد البيانات الخمس كلها في واجهة محادثة واحدة إلى جانب أكثر من 474 مليون ورقة علمية، بحيث يمكنك الانتقال من العثور على الأدبيات إلى البحث عن المركبات ثم إلى التحليل البنيوي دون تبديل الأدوات مطلقًا.
ما الذي يمكنك فعله
- قاعدة بيانات ChEMBL لاكتشاف الأدوية
- خصائص المركبات في PubChem
- قاعدة بيانات ZINC (أكثر من 230 مليون مركب)
- بنى البروتينات في PDB
الأدوات
قارن
Frequently Asked Questions
- ما الفرق بين ChEMBL وPubChem وZINC؟
- تخدم كل قاعدة بيانات غرضًا مختلفًا. يحتوي ChEMBL على بيانات نشاط حيوي منقحة — قيم IC50 وEC50 وKi وKd من اختبارات منشورة — ما يجعله المصدر الأساسي لفهم كيفية تفاعل المركبات مع الأهداف البيولوجية. يوفّر PubChem خصائص المركبات الفيزيائية-الكيميائية مثل الوزن الجزيئي وLogP وTPSA وعدد الروابط الهيدروجينية، وهو مفيد لتقييم ملاءمة المركب كدواء وخصائص ADMET. أما ZINC فيفهرس أكثر من 230 مليون مركب متاح تجاريًا مع معلومات عن المورّدين وقابلية الشراء، ما يجعله أساسيًا للعثور على نظائر قابلة للشراء للمركبات الرائدة. يتيح لك PapersFlow الاستعلام عن الثلاثة جميعًا من جلسة البحث نفسها.
- هل يمكنني البحث باستخدام ترميز SMILES؟
- نعم. يدعم تكامل قاعدة بيانات ZINC البحث عن التشابه باستخدام SMILES عبر مسافة Tanimoto، بحيث يمكنك لصق سلسلة SMILES والعثور على مركبات قابلة للشراء ومتشابهة بنيويًا. بالإضافة إلى ذلك، تُعرض جميع نتائج المركبات من استعلامات ChEMBL وPubChem وZINC وربيطات PDB التي تتضمن بيانات SMILES تلقائيًا كرسومات جزيئية ثنائية الأبعاد تفاعلية مع تلوين خاص بكل عنصر، بحيث يمكنك فحص البنى بصريًا دون مغادرة المحادثة.
- هل يتضمن بيانات بنية البروتين؟
- نعم. يدمج PapersFlow كلًا من PDB وUniProt. يتيح لك تكامل PDB البحث عن بُنى البروتين بالنص أو التسلسل واسترجاع بيانات وصفية مثل الدقة، والطريقة التجريبية، وعدد الذرات، وتفاصيل الربيطة المرتبطة بما في ذلك SMILES وInChI والصيغة الجزيئية. ويوفر UniProt تسلسلات البروتين، وتعليقات المجالات الوظيفية التوضيحية، والتعديلات اللاحقة للترجمة، وربط المعرّفات بين قواعد البيانات. لاحظ أن PapersFlow يعيد البيانات الوصفية البنيوية ومعلومات الربيطة — وليس عارضًا جزيئيًا ثلاثي الأبعاد، لكنه يربط البيانات البنيوية مباشرة ببحثك في الأدبيات.
- هل يدعم تنسيق الاستشهادات ACS؟
- نعم. تكون مخرجات الكيمياء افتراضيًا بنمط استشهاد ACS مع مراجع مرقمة مرتفعة. يمكنك تصدير قوائم مراجع منسقة، وملفات .bib، ومخطوطات كاملة منسقة لـ JACS وACS Nano وChemistry of Materials ومنشورات ACS الأخرى.